Destylarnia założona w 1819 przez księcia Sutherland. Szybko zdobyła uznanie koneserów i już w połowie XIX wieku jej produkty zaliczano do najwyżej cenionych szkockich whisky. Od 1916 roku związana jest z Johny Walker & Sons. Obecnie należy do Diageo. W latach 1969 – 1983 Clynelish był zakładem „podwójnym”. W 1968 roku oddano do użytku zupełnie nową gorzelnię sąsiadującą z budynkami starej. To do niej została przeniesiona cała produkcja. Natomiast w starej destylarni wytwarzano whisky dużo bardziej torfową i wytrawną sprzedawaną pod nazwą Brora. Ten dualizm zniknął wraz z zamknięciem starego zakładu w 1983 roku.