Zakład został oficjalnie uruchomiony w 1849, jednak przez kilkadziesiąt lat funkcjonowania nie wyrózniał się niczym szczególnym na tle szkockich destylarni. W 1918 roku stał się własnością Macdonald & Muir, jednak słaba koniunktura na rynku whisky w latach 20. i 30., a następnie ograniczenia w dostępie do jęczmienia w trakcie II wojny światowej również uniemożliwiały mu rozwinięcie skrzydeł. Los odwrócił się dopiero pod koniec lat 40. i od tego czasu Glenmorangie systematycznie zdobywała coraz większe uznanie konsumentów. W latach 60. i 70. jej moce produkcyjne nie były w stanie zaspokoić popytu. Od 2004 roku zakład jest własnością Louis Vuitton Moët Hennessy. Destylarnia ma centrum dla zwiedzających oraz muzeum.